Altay altyapısından yetişip vitrine çıkan 23 yaşındaki futbolcu, 2018-2019 döneminde Ankaraspor’a transfer oldu.
Başşehir temsilcisi ile 2019-2020 döneminde küme düşen Atakan, çabucak akabinde Muhteşem Lig’e terfi ederek Ankaragücü’ne transfer oldu. Atakan, 2020-2021 döneminde bu defa Ankaragücü ile küme düşme kederi yaşadı lakin tekrar Muhteşem Lig’e transfer oldu.
Geçen dönemi Muhteşem Lig’de Göztepe forması ile geçiren Atakan bu kez İzmir grubunda birebir mukadderatı yaşadı. Lakin, Atakan Ankaragücü’nden kiralandığı için kulübüne geri döndü. Ankaragücü ise tekrar Muhteşem Lig’e yükseldi ve Atakan tekrardan devler arenasında yer almayı garantiledi. Atakan, üst üste üçüncü kere forma giydiği grup küme düşmesine kendisi Muhteşem Lig’de kaldı. Göztepe’de 24 maça çıkan Atakan Çankaya toplam 1577 dakika mühlet alarak kadroda en fazla oynayan futbolcular ortasına ismini yazdırdı.
